Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc4Q8BP86 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snapc4Q8BP86 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snapc4Q8BP86 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms