Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp1Q8BJQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp1Q8BJQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp1Q8BJQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms