Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Frmd3Q8BHD4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Frmd3Q8BHD4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms