Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4dQ8BGV9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4dQ8BGV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms