Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc50Q810U5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms