Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec18aQ7TSQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec18aQ7TSQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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