Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2lQ7TS74 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms