Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmc8Q7TN58 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmc8Q7TN58 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms