Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf139Q7TMV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf139Q7TMV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms