Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed3Q78IS1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed3Q78IS1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed3Q78IS1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms