Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SynmQ70IV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SynmQ70IV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SynmQ70IV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms