Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp8b3Q6UQ17 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8b3Q6UQ17 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8b3Q6UQ17 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms