Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rasa4Q6PFQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasa4Q6PFQ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rasa4Q6PFQ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms