Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt3Q6PE13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt3Q6PE13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms