Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp2d40Q6P8N9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp2d40Q6P8N9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms