Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1BQ6P3S1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1BQ6P3S1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms