Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic1Q6NXK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic1Q6NXK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asic1Q6NXK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Asic1Q6NXK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asic1Q6NXK8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1725.7 ms