Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Wdr44Q6NVE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr44Q6NVE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms