Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2surpQ6NV83 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
U2surpQ6NV83 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2surpQ6NV83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms