Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retreg2Q6NS82 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retreg2Q6NS82 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms