Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf8Q6DID3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf8Q6DID3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf8Q6DID3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf8Q6DID3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.2 ms