Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rftn1Q6A0D4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms