Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CltcQ68FD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CltcQ68FD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CltcQ68FD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CltcQ68FD5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CltcQ68FD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CltcQ68FD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms