Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nlrp4eQ66X19 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp4eQ66X19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp4eQ66X19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp4eQ66X19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrp4eQ66X19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms