Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Knl1Q66JQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Knl1Q66JQ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms