Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt12Q64291 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt12Q64291 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt12Q64291 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt12Q64291 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt12Q64291 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt12Q64291 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt12Q64291 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt12Q64291 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt12Q64291 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt12Q64291 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt12Q64291 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt12Q64291 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt12Q64291 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt12Q64291 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms