Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrmsQ62270 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms