Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3a2Q62203 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3a2Q62203 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms