Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtafrQ62035 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms