Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm1Q60636 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm1Q60636 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms