Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc125Q5U465 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc125Q5U465 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms