Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CluhQ5SW19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CluhQ5SW19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CluhQ5SW19 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms