Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP47Q5SQN1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms