Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rapgef6Q5NCJ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rapgef6Q5NCJ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms