Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NHLRC3Q5JS37 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHLRC3Q5JS37 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLRC3Q5JS37 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLRC3Q5JS37 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHLRC3Q5JS37 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms