Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdh1bQ5F204 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mdh1bQ5F204 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdh1bQ5F204 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms