Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc2Q56A06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc2Q56A06 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms