Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38aQ4FK66 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf38aQ4FK66 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms