Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228bQ497Q6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam228bQ497Q6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms