Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U9

Spag6, Sperm-associated antigen 6, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag6Q3V0U9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spag6Q3V0U9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spag6Q3V0U9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spag6Q3V0U9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms