Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY23

Fdxacb1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdxacb1Q3UY23 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fdxacb1Q3UY23 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fdxacb1Q3UY23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fdxacb1Q3UY23 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms