Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rmdn3Q3UJU9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms