Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy4Q3TYX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy4Q3TYX8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms