Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim43aQ3TL54 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43aQ3TL54 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43aQ3TL54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms