Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrx1Q3TL44 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrx1Q3TL44 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms