Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdlim7Q3TJD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdlim7Q3TJD7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms