Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plekhf1Q3TB82 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhf1Q3TB82 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plekhf1Q3TB82 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms