Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VrtnQ3SYK4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VrtnQ3SYK4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VrtnQ3SYK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms