Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDRF1Q3B7T1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms