Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFKBIBQ15653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFKBIBQ15653 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIBQ15653 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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